Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PSMA3P25788 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms