Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPD1P21695 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPD1P21695 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPD1P21695 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPD1P21695 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
GPD1P21695 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
GPD1P21695 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GPD1P21695 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
GPD1P21695 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GPD1P21695 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms