Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SDSP20132 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SDSP20132 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SDSP20132 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms