Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
CTLA4P16410 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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