Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPA1P15085 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPA1P15085 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPA1P15085 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPA1P15085 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPA1P15085 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CPA1P15085 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CPA1P15085 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms