Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ACTN1P12814 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms