Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RALAP11233 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RALAP11233 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RALAP11233 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RALAP11233 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RALAP11233 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RALAP11233 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RALAP11233 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RALAP11233 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RALAP11233 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RALAP11233 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms