Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACAA1P09110 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms