Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZBED1O96006 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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