Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 GMPS-203ENST00000496455 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 PTPN4-201ENST00000263708 10300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.535e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 SLC39A10-205ENST00000430412 4478 ntTSL 26.2□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 SLC39A10-206ENST00000444421 544 ntTSL 43.3□□□□□ -1.882e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.962e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 HIVEP1-203ENST00000442081 1044 ntTSL 321.8■■□□□ 1.084e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 HIVEP1-204ENST00000478545 576 ntTSL 417.47■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 HIVEP1-209ENST00000627968 8924 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 HIVEP1-206ENST00000487103 585 ntTSL 27.71□□□□□ -1.184e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 HIVEP1-207ENST00000491710 579 ntTSL 34.53□□□□□ -1.684e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-213ENST00000602537 948 ntTSL 524.89■■□□□ 1.586e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-215ENST00000602811 1136 ntTSL 524.74■■□□□ 1.556e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-211ENST00000602305 961 ntTSL 524.74■■□□□ 1.556e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-212ENST00000602375 1064 ntTSL 524.28■■□□□ 1.486e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-214ENST00000602686 977 ntTSL 523.67■■□□□ 1.386e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-207ENST00000582183 551 ntTSL 423.04■■□□□ 1.286e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.42e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.036e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 STAT5A-209ENST00000588868 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-202ENST00000415385 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.666e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MAP2K4-204ENST00000538465 925 ntTSL 55.23□□□□□ -1.576e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.616e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 OSBPL8-207ENST00000548341 542 ntTSL 42.57□□□□□ -24e-6■■■■■ 89.4
SF3B1O75533 MIIP-205ENST00000478749 779 ntTSL 216.42■□□□□ 0.224e-7■■■■■ 89.3
SF3B1O75533 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 89.3
SF3B1O75533 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 89.3
SF3B1O75533 CCNB2-205ENST00000621385 2503 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.033e-6■■■■■ 89.3
SF3B1O75533 TXNDC11-206ENST00000573174 919 ntTSL 326.97■■□□□ 1.913e-6■■■■■ 89.3
SF3B1O75533 TXNDC11-208ENST00000575591 615 ntTSL 314.76□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 89.3
SF3B1O75533 TXNDC11-209ENST00000576969 863 ntTSL 38.29□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 89.3
SF3B1O75533 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 89.2
SF3B1O75533 LBR-203ENST00000421383 736 ntTSL 327.41■■□□□ 1.981e-10■■■■■ 89.2
SF3B1O75533 LBR-205ENST00000425080 874 ntTSL 39.9□□□□□ -0.821e-10■■■■■ 89.2
SF3B1O75533 PIAS1-206ENST00000564915 671 ntTSL 53.99□□□□□ -1.772e-6■■■■■ 89.2
SF3B1O75533 PIAS1-203ENST00000562190 766 ntTSL 33.35□□□□□ -1.872e-6■■■■■ 89.2
SF3B1O75533 RBM6-217ENST00000483350 988 ntTSL 315.44■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 89.2
SF3B1O75533 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-6■■■■■ 89.2
SF3B1O75533 NPEPPS-215ENST00000530173 2864 ntTSL 2 BASIC8.53□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 89.2
SF3B1O75533 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.519e-7■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.353e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 LMF2-203ENST00000504717 1233 ntTSL 528.94■■■□□ 2.222e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-234ENST00000533821 575 ntTSL 427.57■■■□□ 22e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-226ENST00000531230 516 ntTSL 425.73■■□□□ 1.712e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 PPP1CA-207ENST00000532279 552 ntTSL 325.08■■□□□ 1.63e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.491e-12■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DONSON-205ENST00000437395 1719 ntTSL 523.87■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-225ENST00000530841 545 ntTSL 423.3■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.262e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DONSON-203ENST00000417871 1820 ntTSL 522.82■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.232e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.23e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.193e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 CCND3-212ENST00000510058 926 ntTSL 221.07■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DONSON-211ENST00000457359 2273 ntTSL 521.04■□□□□ 0.962e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 PPP1CA-204ENST00000526510 1677 ntTSL 1 (best)20.86■□□□□ 0.933e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 MIDN-205ENST00000591302 523 ntTSL 220.78■□□□□ 0.922e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-237ENST00000534501 613 ntTSL 420.77■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 LMF2-206ENST00000514938 960 ntTSL 520.67■□□□□ 0.92e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.863e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 PPP1CA-208ENST00000532446 1465 ntTSL 519.19■□□□□ 0.663e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.522e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 ABCB6-202ENST00000295750 2238 ntTSL 517.79■□□□□ 0.443e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.351e-12■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.233e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 ABCB6-204ENST00000443805 679 ntTSL 216.35■□□□□ 0.213e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DDX19A-206ENST00000562649 557 ntTSL 516.12■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 TNIP1-206ENST00000519339 1815 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 DDX19A-213ENST00000569319 1643 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 SYBU-223ENST00000529190 1126 ntTSL 514.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 ABCB6-207ENST00000485773 962 ntTSL 214.7□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 89.1
SF3B1O75533 FOS-203ENST00000554212 567 ntTSL 414.55□□□□□ -0.083e-6■■■■■ 89.1
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1443.6 ms