Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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HOXA3O43365 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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