Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ATMINO43313 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ATMINO43313 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ATMINO43313 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms