Protein–RNA interactions for Protein: O14526

FCHO1, F-BAR domain only protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1O14526 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FCHO1O14526 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms