Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRPO00591 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRPO00591 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRPO00591 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRPO00591 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRPO00591 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRPO00591 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GABRPO00591 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GABRPO00591 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GABRPO00591 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms