Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EBAG9O00559 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms