Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PRAMEF26H0Y7S4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PRAMEF26H0Y7S4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms