Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PCH4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PCH4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PCH4 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PCH4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms