Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PRRT4C9JH25 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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