Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
SMIM1B2RUZ4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
SMIM1B2RUZ4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms