Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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ZNF346Q9UL40 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF346Q9UL40 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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