Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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FOXD3Q9UJU5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
FOXD3Q9UJU5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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