Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHPF2Q9P2E5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms