Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
HIGD1BQ9P298 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms