Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SCHIP1Q9P0W5 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SCHIP1Q9P0W5 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms