Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EMILIN3Q9NT22 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms