Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms