Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPHK2Q9NRA0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPHK2Q9NRA0 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 256.5 ms