Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NIFKQ9BYG3 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms