Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CARD11Q9BXL7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms