Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SYCP2Q9BX26 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYCP2Q9BX26 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms