Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 INO80E-209ENST00000567254 625 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SYT17Q9BSW7 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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