Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM175Q9BSA9 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms