Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RHOXF2Q9BQY4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms