Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TSPAN5-202ENST00000505184 1191 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PHOX2BQ99453 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms