Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC7Q96M83 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC7Q96M83 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms