Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRIQ1Q96JM4 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
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