Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX21Q969T3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms