Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP13Q92995 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP13Q92995 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP13Q92995 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP13Q92995 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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USP13Q92995 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
USP13Q92995 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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