Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF3Q92576 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF3Q92576 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF3Q92576 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF3Q92576 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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PHF3Q92576 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF3Q92576 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF3Q92576 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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PHF3Q92576 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PHF3Q92576 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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