Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LRRN4Q8WUT4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRN4Q8WUT4 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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