Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ZNF548Q8NEK5 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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ZNF548Q8NEK5 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ZNF548Q8NEK5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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