Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF248Q8NDW4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms