Protein–RNA interactions for Protein: Q8N815

CNTD1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD1Q8N815 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNTD1Q8N815 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms