Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SVOPQ8N4V2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms