Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLF2Q8IX21 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms