Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z478

DHX29, ATP-dependent RNA helicase DHX29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX29Q7Z478 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHX29Q7Z478 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX29Q7Z478 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms