Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NLRP9Q7RTR0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms