Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RUFY3Q7L099 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms