Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
DUX4L9Q6RFH8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms