Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ATG16L1Q676U5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATG16L1Q676U5 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms